記事内でタグの閉じ忘れがある可能性が高いです。特にDIVタグやコメントアウトの閉じ忘れがあると、サイトが正常に表示されません。
SIRIUS2にはタグの自動修正機能が搭載されていますので、記事編集画面の右クリックメニューの「HTMLタグの自動修正」を選択し、タグの修正を行って下さい。
SIRIUS2では、HTMLを解析して自動修正を行いますが、記事内のHTMLタグの記述によっては100%正しく修正できる訳ではありません。この点に関してはご容赦いただきますようお願いします。